翰林學(xué)研 普通課題目錄（分子生物學(xué)）

課題名稱

卡拉膠酶產(chǎn)生菌的篩選及發(fā)酵條件優(yōu)化

為獲得卡拉膠酶高產(chǎn)菌株,用卡拉膠作為唯一碳源,對(duì)從海水中分離的13株菌進(jìn)行篩選,進(jìn)而采用分子生物學(xué)方法將3號(hào)菌株鑒定為γ變形桿菌綱的Gilvimarinus屬,并應(yīng)用單因素試驗(yàn)和正交試驗(yàn)對(duì)3號(hào)菌株降解活性培養(yǎng)條件進(jìn)行優(yōu)化,結(jié)果顯示較優(yōu)培養(yǎng)條件為:蛋白胨0.20%,卡拉膠0.20%,瓊脂0.001%,氯化鈉2%,磷酸氫二鉀10%,硫酸鎂0.5%,磷酸鐵0.1%,氯化鈣1%,25℃培養(yǎng)2d。

基于Hadoop平臺(tái)的氫分子生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)的分析與實(shí)現(xiàn)

氫分子生物醫(yī)學(xué)技術(shù)的發(fā)展方興未艾,大數(shù)據(jù)相關(guān)技術(shù)成為氫分子生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的最新驅(qū)動(dòng)力。依據(jù)氫分子生物醫(yī)學(xué)科研團(tuán)隊(duì)需求,構(gòu)建氫分子生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)模型,在數(shù)據(jù)中心環(huán)境下,使用Hadoop(分布式存儲(chǔ)技術(shù)基礎(chǔ)框架)建立氫分子生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù),充分利用虛擬化和集群的威力,提高數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)的高速運(yùn)算和存儲(chǔ)分析能力。圍繞Hadoop生態(tài)圈及其技術(shù),實(shí)現(xiàn)了不同數(shù)據(jù)來(lái)源的氫分子生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)提取、轉(zhuǎn)換和加載,變?yōu)橥瑯?gòu)的多維數(shù)據(jù),開(kāi)展數(shù)據(jù)挖掘與分析。通過(guò)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究與計(jì)算機(jī)技術(shù)相結(jié)合,為氫分子生物醫(yī)學(xué)臨床及科研提取更多有價(jià)值的信息。

基因組DNA甲基化及組蛋白甲基化

在真核生物中,DNA甲基化是一種非常重要的表觀遺傳學(xué)標(biāo)記,能影響染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)和基因的表達(dá)。隨著全基因組甲基化測(cè)序的發(fā)展,全基因組范圍內(nèi)的DNA甲基化水平得以了解。文章概述了基因組中啟動(dòng)子、基因本體、增強(qiáng)子、沉默子和轉(zhuǎn)座子等不同元件的DNA甲基化的研究進(jìn)展,以及DNA甲基化與基因表達(dá)調(diào)控間的關(guān)系。啟動(dòng)子的DNA甲基化對(duì)基因的表達(dá)有抑制作用,而基因本體的DNA甲基化與基因的表達(dá)關(guān)系因物種或細(xì)胞類型不同而異。增強(qiáng)子的DNA甲基化狀態(tài)與基因活性呈反比關(guān)系,沉默子則相反呈正相關(guān)。轉(zhuǎn)座子的DNA高度甲基化抑制其轉(zhuǎn)座活性,從而維持基因組的穩(wěn)定性。文章還探討了DNA甲基化與組蛋白甲基化間的相互作用及其對(duì)基因表達(dá)、可變剪切、轉(zhuǎn)錄的調(diào)控作用,以及本領(lǐng)域的未來(lái)研究方向。

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